La première phase est la possibilité de créer un film de moins de cinq minutes, dans un lieu imposé et commun à tous les participants. Lors de cette deuxième édition, c'est un studio de cinéma, Le Rhinocéros à Neuchâtel, qui est mis à disposition des participants . Aucun thème n'est proposé et chaque participant est libre dans son style ou dans ses moyens utilisés. Le festival se veut un tremplin de créativité, et est donc ouvert à quiconque souhaite se lancer dans cette fabuleuse aventure.

La deuxième partie du Festival de Courgemétrage est la présentation des films lors d'une projection publique ouverte à tous, le samedi 16 février 2008. Les films de chaque édition du festival sont également édités dans un DVD vendu dans le but de garantir la pérénnité de la manifestation et de diffuser les films sur une durée prolongée et dans d'autres médias ou festivals.